Pío Baroja y Nessi nace en San Sebastián, España, el 28 de diciembre de 1872. Doctorado en Medicina, Baroja no se dedica a la profesión estudiada sino a la literatura. Es un destacado exponente del grupo de escritores conocidos como la generación del 98. Su obra literaria, compuesta por novelas y obras dramáticas de carácter realista, es amplia y refleja sus preocupaciones y su carácter pesimista.
La vida del autor está signada, desde su infancia, por la escritura: Baroja crece en una familia relacionada con el mundo de las letras, el periodismo y la imprenta. Es bisnieto de Rafael Baroja, quien funda una imprenta en la ciudad de San Sebastián, en la que publica textos y periódicos durante la Guerra de la Independencia. Este negocio familiar es continuado por el abuelo del escritor, también llamado Pío Baroja. El padre del autor es José Mauricio Serafín Baroja Zornoza, un ingeniero de minas con ideas liberales. La familia de Baroja se completa con su madre, Andrea Carmen Francisca Nessi Goñi, y sus hermanos: Darío, que fallece muy joven, Ricardo y Carmen, también escritores. Debido al trabajo del padre, la familia de Pío Baroja se muda varias veces; por ello, pasan tiempo en Madrid, Pamplona y Valencia.
Baroja lee mucho desde chico, pero no se dedica a las letras en un principio. Al terminar sus estudios de bachillerato, estudia medicina en la Universidad Central (actualmente, Universidad Complutense de Madrid) y consigue doctorarse en 1896 con una tesis titulada Estudio acerca del dolor, pero no se siente a gusto con la carrera y luego tampoco como médico al ejercer la profesión. De hecho, en su novela más conocida, El árbol de la ciencia (1911), se alude al ambiente universitario y profesional bajo una mirada mordaz y crítica.
Cuando abandona la medicina, regresa a Madrid y reparte su tiempo entre el trabajo y administración de una panadería familiar y la literatura. Es en esta primera época en la que traba amistad con los escritores José Martínez Ruiz, más conocido como Azorín, y Ramiro de Maeztu. Además, conoce y frecuenta a escritores como Antonio Machado y José Ortega y Gasset. Además de leer mucho, sobre todo filosofía, en las horas en las que trabaja en la panadería, escribe para periódicos y revistas, en las que muestra su adhesión al anarquismo. Esta adhesión irá mermando a medida que avanza la vida del escritor y, con el tiempo, se torna cada vez más conservador. Su anticlericalismo, sin embargo, es una constante a lo largo de toda su vida y es patente en sus obras. La política es algo que le interesa, por lo que llega incluso a postularse, sin éxito, en las elecciones, en dos oportunidades: para concejal en Madrid y para diputado por Fraga.
Su primer libro, Vidas sombrías, es una colección de cuentos vinculados con sus experiencias como médico. Lo publica en 1900 y es celebrado por Miguel de Unamuno y Benito Pérez Galdós. También en este año sale a la luz su primera novela: La casa de Aizgorri, la primera novela de tetralogía Tierra vasca. Es destacable mencionar que el autor ordena su obra literaria en nueve trilogías y dos tetralogías. Además, deja testimonio de su vida a través de una colección de obras autobiográficas, como Juventud, egolatría (1917) y los ocho volúmenes compendiados en Desde la última vuelta del camino (2006).
En 1935, le hacen los honores a Baroja de admitirlo en la Real Academia Española. Durante la Guerra Civil española, emigra a Francia hasta el año 1940.
Baroja muere en Madrid, a la edad de 83 años, el 30 de octubre de 1956.