La novela se divide en los siguientes seis capítulos:
Las garras del dios vivo
Se sitúa en enero de 1981 en Argentina. Está narrada en tercera persona y sus protagonistas son Juan Peterson y su hijo de seis años, Gaspar. Juan Peterson es un poderoso médium que, desde niño y contra su voluntad, forma parte de una secta oscurantista llamada la Orden, liderada por la familia Bradford.
Juan y Gaspar emprenden un viaje en auto desde Buenos Aires hacia Misiones. Allí se encuentra la mansión de la abuela materna de Gaspar y líder de la secta, Mercedes Bradford. Juan debe presentarse allí para realizar un Ceremonial en el que se conecta con la Oscuridad. Él se encuentra al borde de la muerte, y el ritual puede llegar a acabar con su vida. La Orden pretende que Juan, antes de morir, transmigre al cuerpo de su hijo. Así podrá seguir compartiendo sus poderes con los miembros de la secta.
El objetivo de Juan Peterson es salvar a su hijo de la Orden. Gaspar, a sus tempranos seis años, ya está mostrando señales de tener los mismos poderes que su padre. Juan no solo no quiere transmigrar en el cuerpo de su hijo, sino que pretende “marcar” a Gaspar para que la Orden no pueda encontrarlo y utilizarlo como médium, tal como lo hicieron con él.
La mano izquierda. El Dr. Bradford entra en la Oscuridad
Esta segunda parte está situada en enero de 1983, en Misiones, Argentina, y también está narrada en tercera persona. El protagonista es el Doctor Jorge Bradford. Durante todo este capítulo, el doctor Bradford recuerda su historia junto a Juan Peterson mientras este invoca a la Oscuridad. Termina en el momento en el que, precisamente, Bradford es devorado por la Oscuridad.
La cosa mala de las casas solas
El capítulo se sitúa en 1985-1986 en Buenos Aires, y también está narrado en tercera persona. El protagonista es Gaspar Peterson, quien ya tiene diez años, y sus amigos Vicky, Adela y Pablo.
Gaspar Peterson sigue viviendo con su padre Juan, aunque este ya se encuentra muy deteriorado física y mentalmente. Gaspar y sus amigos sienten una gran atracción por lo sobrenatural. Una noche, deciden entrar en una misteriosa casa abandonada que se encuentra en el barrio. Desde el momento en el que cruzan la puerta de entrada, comienzan a ocurrir cosas paranormales. Finalmente, Adela ingresa a una habitación, cierra la puerta y queda encerrada. Los otros niños no logran abrir la puerta y terminan huyendo de la casa. Adela desaparece para siempre. Al final del capítulo, Juan Peterson, tras pasar varios días hospitalizado, muere.
Círculos de tiza
Se sitúa entre 1960 y 1976, en Buenos Aires y Londres. Este capítulo está narrado en primera persona por Rosario Bradford, madre de Gaspar y expareja de Juan Peterson. Rosario Bradford murió en circunstancias sospechosas a fines de 1980, tres meses antes de los hechos que son narrados en el primer capítulo de la novela.
En “Círculos de tiza”, Rosario cuenta la historia de su vida, tanto en Argentina como en Londres, y de la Orden. Aquí, junto a Juan, descubre un pasaje hacia el Otro Lugar, el espacio al que van las personas que son devoradas por la Oscuridad.
El pozo de Zañartú, por Olga Gallardo
Este capítulo está ambientado en Misiones en 1993, y está escrito en forma de crónica. La protagonista es Olga Gallardo, una periodista que viaja a Misiones para realizar una crónica sobre un pozo con cadáveres que fue descubierto allí. Durante su investigación, Olga conoce a Beatriz Bradford. Ella le cuenta lo que sucedió con Adela, y le dice que alguien debería avisarle a Gaspar que es un médium como su padre, y que está en peligro.
Beatriz intenta contactar a Gaspar, pero fuerzas extrañas se lo impiden, y decide abandonar la crónica.
Las flores negras que crecen en el cielo
El sexto y último capítulo se sitúa entre 1987 y 1997, en Buenos Aires. La narración vuelve a estar en tercera persona. El protagonista es Gaspar, que vive con su tío Luis. Hasta entonces, la historia de la Orden y de todo lo que sucedió con su padre le ha sido vedada. Sin embargo, el episodio de Adela sigue atormentándolo, a él y a sus amigos Vicky y Pablo.
A través de Marita, su novia, que trabaja como periodista, Gaspar descubre la inédita crónica de Olga Gallardo: “El pozo de Zañartú”. Luego, la Orden mata a su tío Luis. En el cadáver le dejan un mensaje a Gaspar: "Que venga". Gaspar decide ir a Puerto Reyes a enfrentarse con la Orden.
En Misiones, tras pasar días encerrado por su abuela y las otras líderes de la Orden, quienes esperan que las conecte con la Oscuridad, Gaspar descubre una puerta que conduce hacia el Otro Lugar. Ayudado por Stephen, logra dejar allí atrapados a los líderes de la Orden y conseguir su libertad.